Dirijor de renume mondial, Aleksei Baklan a absolvit Conservatorul de Stat din Kiev „P. I. Ceaikovski”: ca pianist în clasa renumitului muzician M. Suka (1985) și ca dirijor de operă și simfonic în clasa legendarului maestru ucrainean Ștefan Turceac (1987).

Din 1987 — dirijor al Operei Naționale a Ucrainei „Taras Șevcenko”.

În paralel, între 1995 și 2008 — dirijor principal al Teatrului Municipal Academic de Operă și Balet pentru Copii și Tineret din Kiev, iar din 2008 — director artistic al acestui teatru.

Ca dirijor și regizor muzical, a realizat montări în Opera Națională a Ucrainei:

baletele Rusalca de A. Kostin (1993), Coppélia de L. Delibes (1999), Vals vienez pe muzică de Johann și Josef Strauss (2001), Corsarul de A. Adam (2002), Lileya de K. Dankevici (2003), Nunta lui Figaro pe muzică de W. A. Mozart (2006), Daniela de M. Chemberzhi (2007), Zorba Grecul de M. Theodorakis (2008), Legenda iubirii de A. Melikov (2009), Stăpânul Boristenului de E. Stankovici (2010);

În Teatrul Municipal de Operă și Balet pentru Copii și Tineret din Kiev:

operele Rigoletto de G. Verdi (1999), Kosei Nemuritorul (2002) și Noaptea din ajunul Crăciunului de N. Rimski-Korsakov (2009),

muzicalul Cele doisprezece luni de S. Banevici;

compoziția literar-muzicală Cântecul pădurii pe muzică de M. Skorulski (2001);

baletele Petrică și lupul de S. Prokofiev (1999), Baiadera de L. Minkus, Giselle de A. Adam (ambele în 2000), Lacul lebedelor de P. Ceaikovski (2001), Romeo și Julieta de S. Prokofiev (2002), Cenușăreasa de S. Prokofiev, Șopeniana, Carmen-Suita de Bizet–Șcedrin (toate în 2004), Spartacus de A. Haciaturian, Albă ca Zăpada și cei șapte pitici de B. Pavlovski, Frumoasa din pădurea adormită de P. Ceaikovski (toate în 2006), Carnavalul animalelor pe muzică de C. Saint-Saëns (2008), Barmalei și Aibolit de Iu. Șevcenko (2011) — o premieră absolută a baletului compozitorului ucrainean, unde maestrul a fost și autorul libretului.

A dirijat lucrări vocal-simfonice importante:

Recviem de W. A. Mozart (1996),

Simfonia nr. 9 de L. Beethoven, Stabat Mater de G. Rossini (ambele în 1998),

cantata scenică Carmina Burana de C. Orff (1995, 2002);

programe orchestrale: Foc de artificii muzical (2001), Muzica familiei Strauss (2003),

gale de concert: Mozart-Gala (2007), Opera-Gala (2008), Nopțile lui Ceaikovski (2010).

Montări de balet în afara Ucrainei:

la Opera Națională Slovenă (Maribor): Giselle, Frumoasa din pădurea adormită, Lacul lebedelor, Spărgătorul de nuci, Francesca da Rimini (muzica de Ceaikovski), Coppélia de L. Delibes, Baiadera de L. Minkus, Cenușăreasa de S. Prokofiev, Carmen-Suita de Bizet–Șcedrin, Spartacus de A. Haciaturian;

în compania International Ballet Eyes (Nagoya, Japonia): Giselle, Corsarul de A. Adam, Don Quijote, Baiadera de L. Minkus, Frumoasa din pădurea adormită, Lacul lebedelor de P. Ceaikovski;

în compania Ballet Chambre Ouest (Tokyo, Japonia): Tatiana pe muzică de Ceaikovski;

în ansamblul de balet pentru tineret (Hamilton, Canada): Spărgătorul de nuci de P. Ceaikovski;

la Opera Națională a Croației (Zagreb): Giselle de A. Adam, Spărgătorul de nuci, Frumoasa din pădurea adormită de P. Ceaikovski;

la Teatrul Național din Ciudad de México (Mexic): Giselle de A. Adam, Romeo și Julieta de S. Prokofiev.

În 2003, 2006 și 2010 a dirijat concertele stelelor baletului mondial Ballettissimo în Ciudad de México.

A colaborat cu:

Orchestra Filarmonică din Tokyo,

Orchestra Simfonică din Tokyo,

Orchestra Filarmonică din Nagoya (Japonia),

Orchestra Simfonică din Madrid și Orchestra Simfonică a Galiciei (Spania),

Orchestra „Los Americas” din Ciudad de México (Mexic),

Orchestra Simfonică a Operei Naționale Slovene (Maribor),

Orchestra Simfonică a Operei Naționale Croate (Zagreb),

Orchestra Filarmonică din Hamilton (Canada).

Din 2008 colaborează permanent cu Teatrul Național Nou din Tokyo (Japonia) în calitate de dirijor invitat pentru spectacole clasice de balet (Lacul lebedelor de Ceaikovski, Don Quijote, Baiadera de L. Minkus).

Din 2010 colaborează cu compania Corella Ballet (Spania).

Sub conducerea maestrului, orchestra simfonică a operei municipale a susținut turnee în Spania, Portugalia, Italia, Croația, Marea Britanie, Coreea de Sud, Japonia, Liban. În perioada 2005–2009, în fiecare decembrie–ianuarie, Aleksei Baklan a condus turneele ansamblului de balet și ale orchestrei simfonice în Marea Britanie. În 2008 și 2009 a dirijat concerte simfonice și gala Opera-Gala a soliștilor și orchestrei teatrului în Cadogan Hall, Londra.

Din 2023 a început colaborarea ca dirijor invitat cu:

Opera și Baletul Național Norvegian (Oslo)

Opera Regală Suedeză (Stockholm)